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三叠纪(2.51亿-1.99亿年前)

中生代从此时开始。爬行动物仍是陆地的主宰,但双孔类崛起,鳄类为其中的主要类群,恐龙出现,但尚未成为霸主;下孔类中演化出了早期哺乳动物。鱼龙在海洋中兴盛。约2.03亿年前开始,再次发生了一系列全球气候事件,其中包括了持续了一两百万年的全球酸雨,洪水可能肆虐了全球,超过半数的物种灭绝,这就是显生宙历史上的第四次生物大灭绝。
侏罗纪(1.99亿-1.45亿年前)

下孔类在陆地的统治地位被双孔类的恐龙所取代,哺乳动物进入了长达1亿多年的蛰伏阶段。大型长颈恐龙徜徉于林间,带羽毛恐龙演化出了早期鸟类。

蛇颈龙、鱼龙、翼龙等双孔类统治着海洋与天空,鱼龙开始逐渐衰落。
白垩纪(1.45亿-0.66亿年前)

开花的被子植物崛起并开始逐渐成为主要的陆地植物,与被子植物关系密切的昆虫也蓬勃发展。恐龙等爬行动物仍然是动物类群的主导。大约6600万年前,一颗直径10-15千米的小行星或彗星撞击了地球,虽然这次撞击远无法与那些发生在冥古宙的撞击事件相比,导致了整个爬行动物类群的衰落。它是显生宙历史上的第五次生物大灭绝。
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